脐带干细胞
婴儿出生后遗留在胎盘和脐带中的血是干细胞的重要来源。自1988年，脐血干细胞就用来治疗根达综合征、亨达综合征、拉综合征、急性淋巴细胞性白血病等许多儿童疾病。脐血从脐带采集；脐带经过清理消毒后，脐血从脐静脉取出，然后立即分析对于传染物质和组织类型是必要的。脐血在放入液氮备用之前要经过处理，去除血浆。在使用的时候首先解冻，去除防冻剂，注入病人静脉。这种使用其他捐赠人干细胞的治疗方法叫做异源疗法；如果干细胞来自患者本人，即为同源和当从相同个体收集时，它通常指双胞胎。细胞的排外转移是于异类之间进行的（发展非常不充分）和有一点研究潜力。
周边血干细胞
骨髓中存有人体内最主要造血干细胞的来源，而周边血干细胞则是指借由施打白细胞生长激素〈G-CSF〉，将骨髓中的干细胞驱动至血液中，再经由血液分离机收集取得之干细胞。由于与骨髓干细胞极为相近，现已逐渐取代需要全身麻醉的骨髓抽取手术。
胚胎干细胞
胚胎干细胞是从胚泡（由50-100个细胞组成的早期胚胎）未分化的内部细胞团中得到的干细胞。它们是万能的，意味着它们可以发育成为身体内200多种细胞类型中的任何一种。胚胎干细胞现在的研究阶段仍是刚起步。许多研究仍建立在人类以外之动物模式。例如老鼠、牛或是羊等。在人类的胚胎干细胞因为干细胞的取得来源涉及道德伦理上的约束，在干细胞株上的建立有所争议。（因为干细胞株必须取得人类胚胎，再经过培养纯化等。因此许多人认为干细胞株视同为人的一部分）
脂肪干细胞
以往人们因塑身而抽出的脂肪，大部分都当废弃物丢掉，现经由医学专家研究证明:脂肪中含有不够纯但大量的干细胞，干细胞具有体外增生及多重分化的潜力，能运用于组织与器官的再生与修复。
其主要特性为：
低侵入性取得，对人体无害。
最多量的取得方式。
可进行体外增生培养。
可运用于身体组织类型广泛，会自动移至创伤部位，进行修补。
皮肤细胞
在2007年尾，美国和日本两组科学家同时成功把皮肤细胞转化成一种俗称为“iPS”的诱导多能干细胞，并成功使这些干细胞转化成为身体器官的一部分。透过向皮肤细胞植入特定的基因，可诱导皮肤细胞改造，变成类似胚胎干细胞的一种细胞。
血液细胞
在2012年尾，英国剑桥大学的科学家将一名病人血液中一种能修复血管壁损伤的细胞变成了干细胞。这种方法比用皮肤细胞制造干细胞更实用、更有效、更安全，因为，获取血液样本要比获取高质量的皮肤样本更容易。
